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Lo puedes hacer en un paso, pero realmente lo tienes que borrar en Alfa. Después, en unas horas se borrará solo de la colección de Kodi.

@manuelrb0
Puedes darle privilegios de renombrado y borrado a tu Kodi en Settings-Media-General así cuando borre algo desde la librería de Kodi te preguntara que si quieres borrar los archivos si le dice que si, entonces lo borrara por completo de kodi.

En algunos de los casos, si sigue apareciendo pero no los enlaces, entonces tienes que hacer una limpieza a la librería en Settings-Library